教宗本笃十六世于2006年11月30日牧灵访问土耳其时，参观了伊斯坦布尔的蓝色清真寺和圣索菲亚大殿。他在博物馆的烫金签名册中写道：“我们在相异中一同来到唯一天主的跟前。

建设的第三个支柱是“祈祷”，教宗提到他的前任本笃十六世，称他是“为教会继续不断祈祷和效劳的年长圣者”。

教宗本笃十六世11月17日接见正在梵蒂冈参与圣座促进基督信徒合一委员会大会的全体委员，并向他们指出：梵蒂冈第二届大公会议结束四十年来，基督信徒大公合一对话在神学和精神上有许多进展。

（梵蒂冈电台讯）12月24日圣诞节前夕，教宗本笃十六世于中午时分举行了共念三钟经活动。他在带领圣伯多禄广场上的信众念经前，和大家作了简短的谈话，请大家准备好心灵来迎接即将为我们而来临的救主。

教宗本笃十六世1月4日上午访问了位于罗马市中心的“社会餐厅”，受到罗马教区代理主教鲁伊尼枢机、负责罗马市中心区牧灵工作的辅理主教曼达拉等神长和经常在这里受到服务的人士的欢迎。

（梵蒂冈电台消息）1月7日主日是耶稣受洗节，当天上午，教宗本笃十六世在梵蒂冈西斯定圣堂中主持了隆重的弥撒，礼仪中并为来自不同国家的13名婴孩付洗。

教宗本笃十六世昨天2月8日在接见普世博爱运动和圣埃吉迪奥团体之友的主教们时说，教会的运动组织在为教会服务时，可以他们本身的特殊神恩与信德力量来协助主教们面对这三千年代初的各种社会性与宗教性挑战。

三月二十八日星期三上午，教宗本笃十六世在梵蒂冈圣伯多禄广场接见来自各国的两万多名朝圣人士，天气虽然阴冷，人们还是兴高采烈的与教宗会晤。

教宗本笃十六世四月四日上午在梵蒂冈圣伯多禄广场主持周三公开接见活动，向来自各国的朝圣人士讲解圣周巴斯卦三日庆典的意义。

会议结束前，教宗本笃十六世特别致函该科学院院长，美国籍的玛丽·安·葛顿（MaryAnnGlendon）女教授，向全体院士表示：如果不把人视为拥有不可侵犯的尊严的对象，则世界上永远不会有正义。