康熙皇帝亲政后，任命汤若望的助手南怀仁神父主持天文、历法事务。康熙皇帝对西学有着强烈的爱好，每天都要与南怀仁、徐日升、闵明我等传教士一起讲习，同时对基督教也产生了极大的兴趣。

当上主感到人需要一个与之相称的助手时，就着手造女人。经上记载的过程是：“上主天主遂使人熟睡，当他睡着了，就取出了他的一根肋骨，再用肉补满原处。然后上主天主用那由人取来的肋骨，形成了一个女人。

在北京期间，当杨光先诬陷汤若望神父，排斥西法历算、攻击天主教时，利类思神父及其同伴于1662年做了书面答辩，由汤若望神父的助手钦天监副监李祖白付印，并有翰林徐缵曾（教名甘地大的许太夫人之子）为之作序，序文中