1900年（清光绪二十六年），南堂被义和团彻底焚毁，1904年（清光绪三十年），用庚子赔款再次重修。新中国成立后，又经过了多次修缮。

1978年10月，邓小平、李先念等国家领导人批准重修利玛窦墓，1979年后墓地得到了修复，并列入北京市文物保护单位。利玛窦神父在中国传教之所以能够取得成功，在于他走了一条本地化或者“中国化”的道路。

为了重修与其他分离的基督宗教之间的关系，他于1960年成立了促进基督徒合一秘书处，1961年派代表访问君士坦丁堡的东正教宗主教，并于同年11月派员参加在印度新德里召开的世界宗教会议。

第三，注重修院培育。在修院培育中要多一些个人的指导，让他们能够明白面对的困难。

第三，注重修院培育。在修院培育中要多一些个人的指导，让他们能够明白面对的困难。

1900年义和团运动兴起时，墓地遭毁坏后又历经重修。文化大革命时期再次遭到破坏，之后得到局部修葺。

1997年，教区向外发出了求援信，最后集资20多万元在磨子山上重修祭台、围围墙、修水泉、整修道路，做了一系列的修缮工作。如今，磨子山一改往日的荒凉景象，正以崭新的面貌迎接四面八方的圣者。

重修后，堂内装饰也作了调整。从祭台到读经台，再到彩绘玻璃图案以及堂内陈列的数座具有中国本土特色的圣像，无不融合中华传统文化元素。特别引人注意的是小耳堂中的中华圣母像。

老神长们重修教堂，培养圣召，特别是恢复了解散多年的修女会，修女人数从1985年的12位发展到现在的62位。

2005年12月底，由西门子公司出资，南京市人民政府宣布，将在南京大学校园内，重修拉贝故居。来源：新浪新闻