清顺治六年（1649年）清兵入闽，避难延平，四月病逝于福州，葬福州北门十字山。艾儒略传教策略与方法，有一重要特点，就是发挥中国教友和士大夫的作用。

这就是所谓崖山之后已无中国。而且，还有必要再加一句：明亡之后已无华夏。

全是取自圣经，从创世纪到默示录、从造天地到公审判、从天使到人类、从梅瑟到若翰、从天主（=神）、上帝、耶和华、到撒旦、路济弗（=天使长）、从亚当、厄娃到耶稣、玛利亚、从颁发十诫到山中圣训、从锡安（熙雍）山到迦南福地