追溯1995年，若望·保禄二世在一份关于合一的通谕中曾呼吁其他基督徒领袖对如何以新的方式行使教宗职务伯铎圣职发表意见。当时他收到很少的回应。

我们应以身作则，作一个福传的使者，传爱的福音；我们传福音，是传友谊、传爱……在基督的爱内彼此相爱，为中国教会的合一祈祷。”

这一天上午教宗在美丽的里根斯堡的伊斯格林大广场为30万人举行弥撒圣祭；下午访问他曾担任教义神学讲座教授和副校长的里根斯堡大学，在大学大礼堂会晤科学界人士；傍晚则在当地圣伯多禄主教座堂与誓反教各宗派领导人士一同举行大公合一晚祷活动

但他说，那么多东正教弟兄姐妹，非常好的信仰，非常朴实的人，都没有地方恭敬天主，我们一直讲包容、讲合一、讲对话，难道教堂就不能和弟兄分享吗？相比教堂这件事，他的另一个举动引起的争议更大。

只因我们知道，无论我们相隔有多远，都以主的智慧与大能，让我们在基督内保持合一。

感谢天主的指引、神父的带领，使我们能够在赎罪之际、修好之际，给予我们机会，能够在每天的弥撒礼仪中领受爱的盛宴，与耶稣基督幸福合一。

我上次帮忙为祖国筹募捐款就很显示我们的教会是“圣而公教会”，也就是说我们的教会是合一的教会。Catholic就是universal的意思。

我们知道，在中国现代学术史上，对于基督教的评价和宗教的评价，经过了这么几次大的风波，一次是在新文化运动以后，有一个非基运动和非宗教运动，应该说是既是文化运动又是学术运动，形成很多关于基督教在华作用和它的特点及性质的评价

我们在全世界要发起一个相互对话运动。首先我跟日本的池田大作先生已经对话过了。对话期间，就涉及到人类文明严重危机的问题，以及怎么样化公害为公益的问题。

2007年，他倡导一个反对提倡意大利立法授予未婚夫妇，包括同性恋人一些合法权利的运动之后，他受到了死亡威胁。