而对于耶稣会精神的理解，学者历来有很多分歧，甚至尖锐的对立意见。明清时期来到中国的西方传教士多为修会成员，其中耶稣会士做出的成绩尤为世人瞩目。这些修道人士究竟是怀抱什么样的灵修境界？

很久以后想想，我们虽然确实有观点上的分歧，但是主要作祟的还是那个堕落的辩证思维。多年熏陶，已经成为习惯性思维定式了。那种思维定势，就像武侠小说中的武林高手，彼此频出高招，打得难解难分，引人入胜。

炼狱在基督教大分裂中曾是引发分歧的教义之一，由於炼狱没有直接来自于《圣经》的根据故不被大多数东正教、基督新教和基督教系的新兴宗教所接納，炼狱亦被犹太教称为灵薄狱为拉丁语：Limbus、英文：Limbo，

教宗方济各意识到世界各国在这些问题上有严重分歧，而许多人及民族的悲剧仅得到微弱反应的现实令他深受触动。

1905年，马相伯与法国耶稣会士之间由于文化和政治方面的误解引起分歧，从而离开震旦，创办复旦大学，并继续秉承同样教学愿景和理念进行对中国青年的教育工作。

生命恩泉在祷文中祈求圣神带领及助佑周主教，“带领香港教会及所有在羊栈内的子民，团结一致，排除阻碍圣神工作的所有分歧，信靠基督，为香港教区及福传工作而努力，愈显主荣。”

欧洲境内的民族主权国家与因着价值理念的持有和解释出现的分歧和矛盾而形成的罗马公教会、信义宗、归正宗、圣公宗等之间交错着复杂的关联，这样，几个阶段的战争造成损失和伤亡使得这场战争可谓近代史上残酷的欧洲大战

他可以教导我们大公运动所需求的德行：一方面他受到追随自己良知的感召，即使他个人要背沉重的包袱；另一方面与他过去同仁继续保持友谊的热情，促使他同他们本着调和的真意和深入寻求在信仰内合一的精神，一起探索有分歧的问题

我们似乎是一个漫长的蜜月，尽管我们每天争吵，尽管我们有分歧。

中国佛教尽管宗派漫衍,分歧众多,但其共有的特色就是大乘菩萨道精神———普渡众生,主张用自己的体力、智力和财力去救助弱者,即使有汤火之难,刃毒之害,也要喜济众难,决不退却