第三阶段发生在1989年地缘政治改变之后，先教宗若望保禄二世和中国有深入的接触，但是随着一六事件和千禧年封圣，中梵关系停滞，先教宗通过利玛窦400年纪念活动致歉，期望正常化。

由此而入第三阶段。我所愿做的一切，都出于上帝的意思，而不是自己的。

在第三阶段，负面的后果虽然已经张显无疑，如：已有离婚的危机，但此人仍不顾一切继续迷恋色情产品。上瘾的人即使其生活已危殆，仍欲罢不能。色情产品控制了他/她的生命，总是挥之不去。

由整个阶段的神学教育可以得知，中国社会发展情况对天主教神学教育的重大影响，加上天主教教会对中国神学教育的指示，神学教育在中国变成更专业、统一及大规模。第三

。第三阶段（1562-1563），由教宗PiusIV主持。