在文革期间，教堂被占用至1994年才归还，但此时教堂已伤痕累累，成了危房，为了教友们的安全，这座七十多年的老教堂于2012年10月拆除重建，历时一年时间，耗资180多万。

1996年时任本堂常晓悟神父蒙李建唐主教允准，将原堂址拆平重建并扩大规模，10月动工，经过神父、会长及全村教友共筹资金、共同努力，在短短的一年内圣堂建成。

１９９１年，谢廷哲神父成为教区领导人，他立即着手神职人员的培养和教堂的扩建、重建、新建、设点。

迁堂工作于1999年9月25日开始，并于2002年4月25日在新堂所在地--金桥开发区的红枫地段举行了奠基礼：重建工程仅用了一年多时间，一座漂亮的现代化的圣堂就落成了。

1995年1月，教会将原建筑拆去，在原址西按原貌重建圣堂。1996年7月新堂落成开放，总建筑面积4000平方米。1998年上海教区光启社搬迁到伯多禄堂。

罗森经师在发言中，谈到天主教徒与犹太教徒之间重建的兄弟情谊，以及50年来走过的漫长修和道路。他称圣座的新文件是这段路的里程碑。

由于教区主教府面临拆迁重建，所以教区特别开启了港尾天主堂及岭东天主堂两座圣门，作为朝圣之地，让教友们藉朝圣之旅，表达深切悔改，回归父家，获得天父慈悲的宽恕。

弥撒讲道中乔神父向教友介绍了天子印圣山的来历，及经历了破毁，到现在重建，乔神父劝勉教友们要效法，学习为信仰献出了生命的主教，神父，殉道圣人的精神，活出信仰。　　

你们的教会每天都在受苦，却也蒙召播撒和谐、耐心地重建希望，同时得享上主的平安；我们要共同为痛苦不堪的世界奉献这平安。教宗引用圣保禄的话説：若是一个肢体受苦，所有的肢体都一同受苦（格前十二26）。

「耶稣击倒了人际间的隔阂墙垣，重建和平，并着手编织新的友爱之网。不论是在我们的时代还是在教会初期，重拾手足之爱都是极其重要的。我们应当重新发现该如何将空间留给那从不让人分离、却不断使人团结的耶稣。