雍正二年（1724年）朝廷虽已开始禁教，但是宝坻县老家庄、朱家铺教友仍热心奉教。教友在家祈祷，自建教堂，并进京向西洋传教士索取瞻礼单，购买经本、圣像及乐器等物。

1807年，天主教遭禁。但同在这一时期，传教士重返印尼，并成立了巴塔维亚（雅加达）宗座监牧区。1863年，耶稣会传教士领受了弗洛勒斯岛的传教牧灵工作。

新加坡演唱会列为18禁而新加坡的演唱会不仅遭到宗教人士抵制，也被设为限制级，年满18岁的观众才能进场观看。2月28号，麦当娜将在新加坡国家体育场开唱。

日本随后将此处文化遗产总称修改为长崎及天草地区受迫害基督教徒相关遗产，并删去了两个与禁教关联性较弱的遗迹，重新报送给联合国教科文组织。

6个月后，利玛窦的朋友徐光启得知后，拿着皇帝的圣旨，这才解了禁。也有人说是万历皇帝突然想起有奏本称几个西夷要来进贡，贡物清单中有自鸣钟、西洋琴等物件。

当天下午2.30分，教宗将私下参观禁居隐修地，那里是圣方济各和他的追随者退隐祈祷和默想的地方。然后，教宗在圣鲁菲诺主教座堂会见来自亚西细全教区的代表，该教区正在举行教区大会。

1614年，德川家康严格实施禁教令，高山右近不愿背弃信仰，遂与3百名基督徒一同逃到菲律宾；他抵达马尼拉40天後便安息主怀。现今日本大阪高槻城迹公园内矗立着战国时期城主高山右近的雕像。

该主教座堂的始建于1789年，后因官府禁教而被毁。1836年，再次建造起来，又因禁教而被毁。

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清康熙至道光年间，清政府实行禁教，闽浙总督驱逐外国天主教传教士，宫巷天主教堂被查禁、没收，改为关帝庙。福州成为通商口岸后，传教士接踵而来，恢复传教工作，修建圣教。