教宗也将参观世贸中心遗址，与各宗教领袖一起为和平祈祷。教宗在美国访问的最後一个城市是费城，在那里参加第八届世界家庭会议。他访问美国的这3个城市时，将特别关注穷人、囚犯、爱德工作及慈善活动。

如果提议通过后，该遗址会被加入为耶稣降生地：伯利恒之圣诞教堂和朝圣路线的项目。该教堂建筑工程于公元333年竣工。公元529年，被毁于动乱。

随後，教宗将在世界贸易中心遗址会晤各宗教人士，探访天使之后圣母学校，会晤移民儿童与家庭。教宗当天的最後一项活动是在麦迪逊广场花园主持弥撒圣祭。

漂白剂、氨水等腐蚀性高的清洁用品会造成莫大的伤害，不该用在纪念馆、历史建筑物、考古遗址、文物、珍贵动产、布料和织品上，因为它可能会带来不可复原的损害。因此，需要一份手册加以说明。

虔诚的犹太教徒热切希望能重建这一圣殿，但那是不可能的，因为那将意味着要拆除后来在遗址上建起的穆斯林圣所。在圣殿地基附近还建有一座犹太教堂和一座拉比学馆。1981年哭墙被列入《世界遗产目录》。

但是今天，在经历了几代中外考古学家不懈的探索、发掘、研究之后，它早已超越了地域的概念，成为和非洲奥杜维峡谷一样，埋藏人类起源奥秘的宝藏：它是世界古人类遗址分布最为密集的地区，同时，也是世界旧石器文化序列保存最为完整的地区

布雷迪神父表示，经济考虑亦会影响遗址的地点，「金钱亦占一席位。人们会因为那里能否成为旅游景点而有得失」。这项考古工作因战火和资金短缺的关系，挖掘进度一再延后，但博物馆现已开放考古发现，以供游览。

2005年，第29届联合国教科文组织世界遗产大会上，将澳门“大三巴”牌坊等六座天主教堂及遗址列入《世界文化遗产名录》。2010年8月7日，利玛窦铜像在澳门“大三巴”揭幕。

圣座促进新福传委员会主席菲西凯拉总主教在埋葬主保真福的神庙遗址圣母大殿（BasilicadiSantaMariasopraMinerva）主持开幕弥撒。

与会者参观了耶稣会圣保禄书院遗址，今称“大三巴”。利玛窦神父曾在1583年前进入大陆前曾在澳门修读中文。万神父说：“目前在罗马耶稣会总部档案室中，保存了两封利神父从澳门缮写的信，讲述他当时的情况。”