期间和另一位老神父边振方一起，积极复修和新建多座教堂，培育神职和恢复修女院；2004年荣休后，仍把福传牧灵当做首要任务，编写要理，找圣书赠给教友。

在牧灵方面，吕神父更是倾尽心力，吃苦耐劳，想方设法提高教友们的信仰素质，自己亲自带着教友们去学习，为他们邀请老师等。无论年长者或是年幼者都从他那里得到了一位好牧人的关怀，体验到了一份父亲般的温暖。

今年我在一个安静的修会里度我的暑假，无心雕琢我的神学论文，回到生活中的牧灵世界，写点纪念吴神父的文字，算是对我自己良心一个交待吧；我也很想念这位精神上的父亲——这位可敬的有圣德的老神父。

他先加入耶稣会，做了一位修会司铎，然后在初学院、学校和出版社服务多年后，挑起了牧职重担，成了华人第五位枢机，还做过花莲和高雄两地的主教、台湾地区主教团团长、辅仁大学董事长等。　　

现在我们有一个慕道中心管理团队，由指导司铎、牧职修女、平信徒助理组成，慕道中心（慕道团）下设有三个板块：慕道团、培育团、办公室。慕道团：分为慕道和再慕道。我们首先从陪伴员入手，陪伴员分为A组和B组。

其理由是爲落实教产，爲发展教会，爲争取更多传教牧灵的空间和机会。地方政府：保护合法，制止非法。政府视已登记的新教区爲合法社团，保护支持；而没有登记的老教区则被视爲非法，限制取消。

这个枢机委员会由教宗方济各任命的8位枢机组成，旨在辅佐教宗治理普世教会和修订为罗马圣座颁布的«善牧»宪章。

之后听告解，缓解座堂神父的牧灵工作压力，满足了教友办告诫的急需。主教为侯洗者施洗周六复活前夕弥撒中，主教祝圣圣水与圣火，之后为慕道者施行了圣洗圣事。

梵蒂冈第二届大公会议提倡的更新开启了一条路，龙卡利教宗与真福若望保禄二世教宗一起封圣令人感到特别喜乐，若望保禄二世把这更新在他长时间的牧职中推向前。

之后，我们交流一些牧灵经验。他对我说，他初任主教时，就遇到一个非常艰巨的任务，教内矛盾重重，他认为思想认识的问题，就应该沟通，求得共识，决不能以相互指责、相互对立，这无益于问题的解决。