教宗静默祈祷後，降福了在主教座堂外等待他的众多信友，并期勉厄瓜多尔「没有分歧，无人受到排斥」。教宗表示：「我以朝圣者的身份来到基多，与你们分享福传的喜乐。」

信德网据亚洲新闻讯相隔仅几十米之遥的金顶清真寺和哭墙，无疑标志着伊斯兰信徒和犹太人之间的关系———相隔咫尺、分歧巨大。

谈到南韩教会，尤其是媒体提到的韩国神职界的分歧意见，姜禹一主教认为，分歧并非教义上的，而是对教会角色的两种不同观点：一种主张效法独裁时期的金枢机，更加关注社会议题，另一种则认为这不是教会的工作。

教宗表示，天主教会肩负着大公主义的责任，路德宗信徒与天主教徒之间的对话获得了显著进步，虽然神学分歧犹在，但不缺少友爱共处。

由于拉丁语中“从子而来”的表述被称为“Filioque”，因此引发了这一名称的争议，这曾经是东正教和西方教会之间如此多争议和分歧的原因(或借口)。

为跨越圣门，禧年筹办者在协和大道为朝圣者设置了专用“通道”，使朝圣者方便进入圣伯多禄广场，在“通道”中有志工负责引导跨越圣门的朝圣者。

此外，传教士们在讲话中都特别谈到了当今的福传需要跨越疆域。母佑会一位修女表示，“今天，跨越地理、社会、文化和政治疆域，直达人们的心灵更加容易了”。而母佑会，就是为此而成立的。

此外，教宗方济各与本笃教宗一同跨越圣伯多禄大殿的圣门，也使得这道圣门蒙受更多的祝福」。圣伯多禄大殿去年12月8日开启圣门时，荣休教宗本笃十六世曾跨越圣门，随後又再退隐在祈祷中善度禧年。

6千多名参加司铎禧年活动的司铎和修生於活动首日前往圣伯多禄大殿朝圣，跨越圣门，并按照各自的语言组别在罗马的不同圣堂聆听要理讲授，参加弥撒。圣座文化委员会主席拉瓦西枢机负责向意大利语言组与会者讲授要理。

弥撒礼成后，吊炉、十字在前，教友、主日学、合唱团、服务组、修士、修女、神父、主教依次排队跨越即将关闭的慈悲圣门。