其后该建筑物在义和团之乱中被焚毁，1903年重建后一直由教会使用。到五十年代政治动荡期间，被天津手帕厂生产车间占用，直至工厂近年拆迁后，仁慈堂遗址才重新被发现。

1835年，整座书院及教堂大部分遭大火焚毁，如今只剩下前门石壁及石台阶。

一欢呼之火（圣枝主日）你这不幸的生于欢呼的人注定要被欢呼焚毁被它撕裂就像棕榈最终的燃烧外氅最终的破碎看吧只有那长耳又沉默的坐骑能辨别出雷响的欢呼是逃亡与鸟飞兽散的火信啊即使那遥远的混沌中的泪泉枯竭时你亦不能熄灭这熊熊的烧焦雏鹰翅膀的欢呼之火二麦粒之使命

教宗以此事迹解释说，在基督徒的入门圣事中，圣神是主要的创造者，祂焚毁并破坏了原罪，归还给领洗者神圣恩宠的美好。

不幸的是，政府宣称要在焚毁的地区再种植树木，但是后来就不再那么关注了。这有助于那些想烧毁树林而建造房屋的人。

本堂贾鸣远司铎立即严加防范，除将死者之屋宇衣服尽行焚毁外，并禁止全村居民出入往来（这与现在政府提倡的隔离、封村、封路相似）。

1876年，皖南宣城、宁国等地的天主教堂被焚毁，传教士黄之绅、教友杨琴锡等人被杀。1877年，乔迁于神父往宁国传教，卞良弼神父到广德传教。1880年建造宣城水东天主堂。

复原圣保禄学院天主之母堂曾是不少澳门人的梦，然而，随着时代及数码科技的发展，能让澳门人这个美梦成真：“通过数字技术实现了本澳世界遗产保护传承的重大突码，首次综合运用三维建模、裸眼3D、VR及AR等仿真技术，将被焚毁的教堂历史风貎作出细致的复原

弥撒开始前，石家庄教区申奇龙神父邀请师晓亮神父介绍文致和主教及其同伴殉道事迹：1899年文致和被派遣来中国传教，1900年义和团包围了教友们的住宅，小教堂也被焚毁，但文主教却无所畏惧，牧灵工作在混乱中依然继续

若望十世宗主教指出：「我们有十几座圣堂遭劫掠和被损坏，数以千计的圣像和手稿遭焚毁或被拿到黑市贩卖。我们不是为了做异乡的难民而出生，也不是为了蒙羞受辱而受造。