本笃十六世在冈道尔夫堡住了两个月之后，5月2日下午返回梵蒂冈。他抵达教会之母隐修院时受到教宗方济各的迎接，然后二人一起进入修院内的小堂祈祷。

教宗本笃十六世12月7日任命圣座万民服务部部长斐洛尼枢机为特使，主持印度韦兰卡尼救援之母朝圣地建立50周年和印度主教团成立25周年庆典活动，这些活动将在明年2月9日至11日举行。

　　教宗本笃十六世于3月26日下午抵达古巴进行牧灵访问，正当古巴庆祝科夫雷仁爱圣母像发现四百周年，仁爱圣母像巡回全岛各教区结束之际。

世界主教会议会场(VaticanMedia)正在梵蒂冈举行的世界会议“催生”了深入探讨一系列主题的进程，集中讨论与会者正在反思的一些重要议题。

信德网据梵蒂冈电台讯直到2008年9月还对比约十二世教宗册封真福的案件提出疑问，现在却为他祈祷，提议要承认这位帕切利教宗是个圣人。

这位意大利主教团主席在全国圣召中心年度会议结束的机会上勉励司铎、会士和修女，还有平信徒聆听天主的意愿，建立真正共融的团体。他说：“在这个团体中产生圣召。”

教宗本笃十六世6月28日宣布，将于2009年10月4日至25日在梵蒂冈召开第二届非洲主教特别会议。这届会议的主题是“非洲教会为修和、正义及和平服务。你们是地上的盐…世界的光（玛5,13,14）”。

　　黎巴嫩共和国总统府和黎巴嫩天主教主教团大众委员会于4月8日复活节，正式宣布教宗本笃十六世将于2012年9月14日至16日访问黎巴嫩。

4月16日是教宗本笃十六世84岁的生日，各国领袖、教会重要人物、文化界代表以及一般信徒，纷纷从世界各地寄上他们对教宗本笃十六世84岁生日的祝贺。这一天，教宗一如往常工作，从私人的接见活动开始。

教宗本笃十六世于1月9日下午，到意大利天主教大学罗马医学院附设综合医院探望埃切卡莱(RogerEtchegaray)枢机主教。