最後，教宗祈愿两个教会放下历史包袱，开启友爱的新时代。他说：我们意识到历史留下了一个误解和不信任的痛苦包袱，为此我们要祈求天主的宽恕和治癒。

当天出发前，他在圣玛尔大之家的清晨弥撒中特别为这和平会晤祈祷，祈愿众人超越宗教分裂，为战争的祸害感到羞愧。教宗表示，战争之神不存在。

美国主教和天主教救济服务机构充满对天主的希望，祈愿政府的工作有助於增加美国的物质、社会和精神财富，增强全世界的团结友爱之情。

教宗祈愿他们的殉道能在教会内唤起以坚忍见证慈悲福音的渴望。最後教宗也特别提及隔天5月8日诵念向庞贝圣母祈求祷文，説道：在这5月圣母月，让我们诵念玫瑰经，尤其为和平祈祷。

教宗为普世万民恳求「和谐之恩」，祈愿世人效法牧童方济各和雅钦大的榜样，「击倒所有围墙，跨越每条界线，走向所有边缘地区，彰显天主的正义与和平」。

教宗祈愿圣神不仅沛降希望，更让我们对有需要的人挥霍希望。

教宗最後祈愿圣母玛利亚帮助我们越来越意识到从天主那里得到的宽恕是无偿和伟大的。我们也要像祂一样慈悲；祂是好父亲，极其慈悲，缓於发怒。

伯克表示，在这痛苦的时刻，教宗「呼吁为智利教会祈祷，祈愿这些会晤能在平静和信任的氛围中进行」，好能「弥补伤痛，并且永远避免滥用良心和滥权，特别是预防在教会内的性侵犯」。

主教们也因在南苏丹的和平会谈取得了进展而欣喜，祈愿有关方面尽快找到解决方案。

教宗以他儿时的亲身经历祈愿双方改变这种状况。