其后该建筑物在义和团之乱中被焚毁，1903年重建后一直由教会使用。到五十年代政治动荡期间，被天津手帕厂生产车间占用，直至工厂近年拆迁后，仁慈堂遗址才重新被发现。

教会在这背景下早已展开重建工作，即使尚需相当久的时间。教会曾遭受的迫害非常严厉，生活非常艰难，着实受到蹂躏：除了教堂和许多敬礼圣所被摧毁外，修道人员几乎全部被消除。

在原稿中，教宗邀请大家不要忘记他们，因为那里的重建工作无法在数天或数月内完成，重建工作需要数年的时间！所以，需要陪伴他们，给他们提供资源，有很多机构提供了很多物质资源。

这座圣堂的修复工程属於援助苦难教会组织重建尼尼微平原基督徒村庄的计划之一。因着这项计划，尼尼微平原目前已有33%的基督徒，也就是6330户家庭平安返乡。

这3名女童现在暂时被安置在安全的收容中心，她们迫切需要教育、照顾和融入社会的进程，好能帮助她们重建生活，重建她们的当下和未来。」

新堂易地重建，占地3.7亩，为哥特式建筑，钟楼高34米，面积520平方米，办公楼两层共400平方米，历时3年，于去年7月竣工。（刘世旺吕付勇）

新堂于去年11月开工重建，今年4月完工。新堂具哥特式风貌，长28米，宽12米，钟楼高24米，建筑面积458平方米，能容纳500余人。（张良）

祈求上主祝福灾区人民，逝者安息，生者坚强，家园重建。

2009年6月重建，10月完工。

九江教会两次共爱心捐款38100元，为四川教会重建修复教堂尽绵薄之力。