贝尔托内枢机主教强调：教宗对伊斯兰教的立场是非常明确的，那无非是梵蒂冈第二届大公会议文献《教会对非基督宗教态度宣言》第三节的态度立场。

他与米兰总主教斯科拉枢机一同为这次大公合一的时刻开启了序幕。　　

关于过主日，梵二大公会议《礼仪宪章》这样说：在这一天，基督信徒都应该聚会，听取天主的圣言，参与感恩祭，纪念主耶稣的受难、复活与光荣升天，感谢天主，因为他曾‘藉耶稣基督从死者中的复活重生了&rsquo

其实，天主教的发展之所以落后于基督新教，最大最主要的原因是：基督新教保持了特利腾大公会议以前教会传自宗徒的传教传统：人人传教、人人宣讲，随时宣讲、随地宣讲。

1962至1965年间，他以专家身份应邀参与梵蒂冈第二届大公会议，并在会议期间出任科隆总主教弗林斯枢机的神学顾问，为大公会议做出重大贡献。

斐洛尼枢机回顾水原教区历史时表示，保禄六世教宗于1963年10月7日创建该教区时，罗马正如火如荼地召开梵二大公会议。枢机说：「神长们在短短数周内通过了礼仪改革，并着手准备《教会宪章》。

君士坦丁堡大公宗主教巴尔多禄茂一世在此机会上寄给与会者一封信函，他写道：中东基督徒的消失是人类的悲剧，同时也是历史和文明的重要问题。

为此，他於6月2日寄给波黑人民一个视频讯息，再次提及这次访问的格言「愿你们平安」，并强调这次访问的目的是支持该国的「大公对话、宗教交谈」以及和睦共处。

祈祷结束后，教宗要求众人为当天下午在梵蒂冈内举行的祈祷聚会祈祷；以色列总统佩雷斯、巴勒斯坦总统阿巴斯，和君士坦丁堡大公宗主教巴尔多禄茂一世均参与了下午的祈祷活动。　　

教宗为此向北非主教们指出，他们教区内的司铎、会士和平信徒应该受到大公和跨宗教对话的培育。